autoLiterature是一个基于Python的自动文献管理命令行工具。Inspired by Mu Li.
识别规则：
- 自动识别
- {xxx}。 - 当笔记文件中包含
- {paper_id}时候，会下载该文献的信息，不下载PDF。 - 当笔记文件中包含
- {{paper_id}}时候，会下载该文献的信息，以及PDF。
注意：paper_id支持已发表文章的doi,预发布文章的arvix_id, biorvix_id, medrvix_id。
- pip 安装
pip install autoliter
或者
pip3 install autoliter- 源码安装
git clone https://github.com/WilmerWang/autoLiterature.git
cd autoLiterature
python setup.py install autolter
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
-i INPUT, --input INPUT
The path to the note file or note file folder.
-o OUTPUT, --output OUTPUT
Folder path to save paper pdfs and iamges. NOTE: MUST BE FOLDER
-p PROXY, --proxy PROXY
The proxy. e.g. 127.0.0.1:1080
-d, --delete Delete unreferenced attachments in notes. Use with caution,
when used, -i must be a folder path including all notes
-m MIGRATION, --migration MIGRATION
the pdf folder path you want to reconnect to假设input为文献笔记(md文件)的文件夹路径，output为要保存PDF的文件夹路径。
# 更新input文件夹下所有md文件
autoliter -i input -o output
# 仅更新input/example.md文件
autoliter -i input/example.md -o output
# -d 是个可选项，当 -i 是文件夹路径时候，使用 -d 会删除PDF文件夹下和文献笔记内容无关的pdf文件
autoliter -i input -o output -d当要移动文献笔记或者PDF文件夹的时候，文献笔记中的PDF链接可能会变的无法使用。可以使用-m来重新关联PDF文件和文献笔记。
# 更新input文件夹下所有md文件
autoliter -i input -m movedPDFs/
# 仅更新input/example.md文件
autoliter -i input/example.md -m movedPDFs/ 更多可以本地查看jupyter note，或者在线查看github doc文件夹。
MIT
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