data/clean/all_scores.csv: Enthält alle VarID:Wert-Paare, sortiert nach Patient und Zeitpunkt data/clean/labels_nearest_all.csv: ? data/clean/labels_nearest.csv: ? data/clean/labels.csv: ?
Das Verzeichnis /data/ ist .gitignored, sodass keine patientenbezogenen Daten im öftl. git-repo vorliegen. Ohne diese funktioniert aber der Großteil des Codes nicht. Bei Bedarf also manuell Daten aus COPRA exportieren oder mich fragen
für besseres Modell:
- NRS/VAS Bedingungen mit einbeziehen, jeweils 1 Spalte für "ruhe", "intervent" (one hot encoding)
http://ksrowell.com/blog-visualizing-data/wp-content/uploads/2012/02/optimal-colors-for-graphs.png Colors: blue: #3969b1 orange: #da7c30 green: #3e9651 red: #cc2529
| Dateiname | Beschreibung |
|---|---|
| delir.csv | Gibt für einzelne Patienten an, ob die Diagnose Delir nach ICD gestellt wurde (F05.*). |
| patienten.csv, patienten20200312.csv | Metadaten über einzelne Patienten (Alter, Geschlecht, Zeit auf ICU etc). patienten20200312.csv enthält zusätzlich BMI |
| scores1.csv | Enthält Scores der VarIDs 20512769,20512802,20512801 (GCS, DDS, BPS) pro Patient und Zeitpunkt. |
| scores2.xlsx | Enthält Scores der 10 VarIDs aus Tabelle daten pro Patient und Zeitpunkt |
| VarIDs.xlsx | Menschen-lesbare Namen der VarIDs |
Die Spalte "Zeitpkt" in den scores-Dateien bezieht sich auf "für wann die Eintragung gelten soll" und ist berechnet in "Sekunden nach Aufnahme ins Krankenhaus"
| VarID | Wert | Inhalt | Tabelle |
|---|---|---|---|
| 20512802 | DDS (Delirium Detection Score) | int, 1-35 (?) | scores |
| 20512769 | GCS (Glasgow Coma Scale) | int, 3-15 | scores |
| 20512801 | BPS (Behavior Pain Scale) | int, 3-12 | scores |
| 22085815 | Visite_ZNS | Text, idr kurz | daten |
| 22085836 | Visite_Pflege | Text, eher länger | daten |
| 22085820 | Visite_Oberarzt | Text, idr lang | daten |
| 22085897 | Ramsay Sedation Scale (ähnl. RASS, wird aber nicht oft erhoben) | int, 1-6 | daten |
| 22086169 | CAM-ICU (Confusion Assessment Method) | (neg./pos.) | daten |
| 22086158 | RASS (Richmond Agitation Sedation Scale) | int, +4 - -5 | daten |
| 22086067 | Vigilanz | Freitext, 1 Wort (z.b. "wach","somnolent") | daten |
| 22086170 | BPS-Bewertung | Freitext, 1-2 Worte (fast immer "ruhe") | daten |
| 22085911 | NRS/VAS (Schmerz?) | int (0-9) | daten |
| 22086172 | NRS/VAS Bedingungen | Freitext, 1-2 Worte (sehr ähnlich zu BPS) | daten |
Häufigkeiten von Text-Wert-Paaren, die 45 Min oder weniger entfernt zueinander sind: text_varid label_varid n 22085815 20512769 13208 22085815 20512801 5761 22085815 20512802 4380 22085815 22086158 11022 22085815 22086169 10307 22085820 20512769 3284 22085820 20512801 694 22085820 20512802 646 22085820 22086158 1744 22085820 22086169 1562 22085836 20512769 14653 22085836 20512801 5851 22085836 20512802 4707 22085836 22086158 11637 22085836 22086169 10712
VarID n_rass percentage
<int> <int> <dbl>
1 22085815 8426 35.0 2 22085820 446 3.82 3 22085836 284 1.03
Delirium Detection Score (DDS) hat nur 5 Parameter, richtig? Weil max score laut histogramm 35 ist --> Richtig! DDS eher zur bestätigung eines vorliegenden Delirs. Wird idR nur von pflegeperson eingetragen DDS besser geeignet, verlauf eines bestehenden delirs zu beschreiben, als nur cam-icu
"wichtiger schritt, die eingabetexte in numerische vektoren fester länge zu überführen." --> wird als embedding bezeichnet.
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