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Repositório de dados sobre SARS-COV-2 em municípios paulistas

dados-covid-sp's Introduction

Repositório de dados sobre casos e óbitos decorrentes do COVID-19 nos municípios do Estado de São Paulo e sobre leitos e internações por Departamento Regional de Saúde

Apresentação e dados

O SEADE mantém um painel de dados sobre casos e óbitos relacionados ao coronavírus no Estado de São Paulo a partir de dados oficiais da Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo (SES). Os dados estão disponíveis em https://www.seade.gov.br/coronavirus/.

NOTA 17.11.2023

A partir da semana de 19 de novembro de 2023, os conjuntos de dados passarão a ser atualizados semanalmente às quartas-feiras. Os cálculos serão ajustados para contabilizar a evolução dos casos por semana epidemiológica. Os dados serão divulgados integralmente no Repositório Seade. Para preservar o acervo histórico dos dados, o presente repositório do Github será mantido, mas não será mais atualizado. A última atualização dos dados diários será feita em 18/11/2023.

NOTA 10.03.2023

A partir de 11 de março de 2023 os conjuntos de dados não serão atualizados nos finais de semana e feriados. Os dados não publicados serão incluídos no dia útil subsequente.

NOTA 01.03.2023

A partir de 01.03.23, as atualizações bancos de dados completos de casos e óbitos por municípios e data; casos, óbitos e doenças pré-existentes; casos, óbitos por raça/cor e município também serão divulgados no Repositório do SEADE.

A partir de 08.03.23, as atualizações dos arquivos anteriormente referidos não serão mais disponibilizados via GitHub, e serão disponibilizados somente via Repositório do SEADE.

A partir de 01.03.23, o arquivo de casos e óbitos passa a ser publicado sem as seguintes variáveis: casos_pc, obitos_pc, nome_drs, cod_drs.

As colunas excluídas continuarão a ser publicadas no arquivo informado acima: AQUI link para arquivo no Repositório do SEADE.

Casos e óbitos

Casos e óbitos por municípios e data: Download dos dados de casos e óbitos: AQUI.

Leitos e Internações

Leitos e internações por Departamento Regional de Saúde segundo os critérios utilizados no Plano SP.

Série antiga (variação mensal): AQUI.

Série antiga (variação semanal): AQUI.

Série em uso (variação semanal e Grande São Paulo unificada): AQUI.

SRAG

Hospitalizados por Síndrome Respiratória Aguda Grave (SRAG). Fonte: SIVEP-Gripe. Download dos dados de casos de SRAG: AQUI. Última atualização: 15/06/2020

Dicionário dos dados de hospitalizados por SRAG AQUI

Casos, óbitos e doenças pré-existentes

Casos e óbitos por doenças pré-existentes, sexo e idade. Fonte: SIVEP-Gripe. Download dos dados de casos, óbitos e doenças pré-existentes: FORMATO .zip.

Casos, óbitos por raça/cor e município.

Casos e óbitos por doenças pré-existentes e município. Fonte: SIVEP-Gripe. Download dos dados casos, óbitos por raça/cor e município: FORMATO .zip.

Dicionário de variáveis, fontes primárias e demais informações técnicas

Dicionário para o arquivo de casos e óbitos

Variável	Descrição
nome_munic	Nome do município
codigo_ibge	Código do município no IBGE (7 dígitos)
datahora	Data no formato YYYY-MM-DD
casos	Casos totais registrados até a data
casos_novos	Casos novos registrados na data
casos_mm7d	Média móvel dos últimos 7 dias dos novos casos
obitos	Óbitos totais registrados até a data
obitos_novos	Óbitos novos registrados na data
obitos_mm7d	Média móvel dos últimos 7 dias dos novos óbitos
letalidade	casos / obitos
pop	População Estimada (fonte: SEADE)
semana_epidem	Semana Epidemológica

Dicionário para o arquivo de leitos e internações

Série antiga

Variável	Descrição
datahora	Data no formato YYYY-MM-DD
nome_drs	DRS ou região da Grande São Paulo
pacientes_uti_mm7d	Média móvel para 7 dias do Pacientes Internados em Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia
total_covid_uti_mm7d	Média móvel para 7 dias do Total de Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia
ocupacao_leitos	Ocupação de leitos de UTI destinados para COVID-19 (pacientes_uti_mm7d / total_covid_uti_mm7d)
pop	População da DRS ou região da Grande São Paulo (Fonte: SEADE)
leitos_pc	Leitos Covid-19 UTI por 100 mil habitantes (total_covid_uti_mm7d / pop)
internacoes_7d	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 nos últimos 7 dias
internacoes_7d_l	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 nos 7 dias anteriores
internacoes_7v7	Variação no número de novas internações ((internacoes_7d - internacoes_7d_l) / internacoes_7d_l)
pacientes_uti_ultimo_dia	Pacientes Internados em Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no último dia
total_covid_uti_ultimos_dia	Total de Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no último dia
ocupacao_leitos_ultimos_dia	Ocupação de leitos de UTI destinados para COVID-19 no último dia (pacientes_uti / total_covid_uti)
internacoes_ultimo_dia	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 no último dia
pacientes_enf_mm7d	Média móvel para 7 dias do Pacientes Internados em Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no dia
total_covid_enf_mm7d	Média móvel para 7 dias do Total de Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no dia
pacientes_enf_ultimo_dia	Pacientes Internados em Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no último dia
total_covid_enf_ultimos_dia	Total de Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no último dia

Série nova variação semanal

Variável	Descrição
datahora	Data no formato YYYY-MM-DD
nome_drs	DRS
pacientes_uti_mm7d	Média móvel para 7 dias do Pacientes Internados em Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia
total_covid_uti_mm7d	Média móvel para 7 dias do Total de Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia
ocupacao_leitos	Ocupação de leitos de UTI destinados para COVID-19 (pacientes_uti_mm7d / total_covid_uti_mm7d)
pop	População da DRS ou região da Grande São Paulo (Fonte: SEADE)
leitos_pc	Leitos Covid-19 UTI por 100 mil habitantes (total_covid_uti_mm7d / pop)
internacoes_7d	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 nos últimos 7 dias
internacoes_7d_l	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 nos 7 dias anteriores
internacoes_7v7	Variação no número de novas internações ((internacoes_7d - internacoes_7d_l) / internacoes_7d_l)
pacientes_uti_ultimo_dia	Pacientes Internados em Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no último dia
total_covid_uti_ultimos_dia	Total de Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no último dia
ocupacao_leitos_ultimos_dia	Ocupação de leitos de UTI destinados para COVID-19 no último dia (pacientes_uti / total_covid_uti)
internacoes_ultimo_dia	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 no último dia
pacientes_enf_mm7d	Média móvel para 7 dias do Pacientes Internados em Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no dia
total_covid_enf_mm7d	Média móvel para 7 dias do Total de Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no dia
pacientes_enf_ultimo_dia	Pacientes Internados em Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no último dia
total_covid_enf_ultimos_dia	Total de Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no último dia

Série nova

Variável	Descrição
datahora	Data no formato YYYY-MM-DD
nome_drs	DRS ou região da Grande São Paulo
pacientes_uti_mm7d	Média móvel para 7 dias do Pacientes Internados em Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia
total_covid_uti_mm7d	Média móvel para 7 dias do Total de Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia
ocupacao_leitos	Ocupação de leitos de UTI destinados para COVID-19 (pacientes_uti_mm7d / total_covid_uti_mm7d)
pop	População da DRS ou região da Grande São Paulo (Fonte: SEADE)
leitos_pc	Leitos Covid-19 UTI por 100 mil habitantes (total_covid_uti_mm7d / pop)
internacoes_28d	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 nos últimos 28 dias
internacoes_28d_l	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 nos 28 dias anteriores
internacoes_28v28	Variação no número de novas internações ((internacoes_28d - internacoes_28d_l) / internacoes_28d_l)
internacoes_ultimo_dia	Número de novas internações (UTI e Enfermaria) de pacientes confirmados ou com suspeita de COVID-19 no último dia
pacientes_enf_mm7d	Média móvel para 7 dias do Pacientes Internados em Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no dia
total_covid_enf_mm7d	Média móvel para 7 dias do Total de Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no dia
pacientes_enf_ultimo_dia	Pacientes Internados em Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no último dia
total_covid_enf_ultimos_dia	Total de Leitos de Enfermaria Destinados para COVID-19 no último dia

Dicionário para o arquivo de Casos, óbitos e doenças pré-existentes

Variável	Descrição
codigo_ibge	Código do município no IBGE (7 dígitos) de residência do paciente
nome_munic	Nome do município de residência do paciente
idade	Idade do paciente
cs_sexo	Sexo do paciente
diagnostico_covid19	Confirmação de COVID-19
data_inicio_sintomas	Data de início dos sintomas
obito	Indica se o paciente veio a óbito por COVID-19
asma	Paciente apresenta esse fator de risco (asma)
cardiopatia	Paciente apresenta esse fator de risco (cardiopatia)
diabetes	Paciente apresenta esse fator de risco (diabetes)
doenca_hematologica	Paciente apresenta esse fator de risco (doença hematológica)
doenca_hepatica	Paciente apresenta esse fator de risco (doença hepática)
doenca_neurologica	Paciente apresenta esse fator de risco (doença neurológica)
doenca_renal	Paciente apresenta esse fator de risco (doença renal)
imunodepressao	Paciente apresenta esse fator de risco (imunodepressão)
obesidade	Paciente apresenta esse fator de risco (obesidade)
outros_fatores_de_risco	Paciente apresenta outros fatores de risco
pneumopatia	Paciente apresenta esse fator de risco (pneumopatia)
puerpera	Paciente se encontra nesse estágio (puérpera)
sindrome_de_down	Paciente apresenta esse fator de risco (síndrome de down)

Casos, óbitos por raça/cor e município

Variável	Descrição
codigo_ibge	Código do município no IBGE (7 dígitos) de residência do paciente
nome_munic	Nome do município de residência do paciente
nome_drs	Nome do Dpto. Regional de Saúde de residência do paciente
obito	Indica se o paciente veio a óbito por COVID-19
raca_cor	Cor ou raça do paciente
idade	Idade do paciente
cs_sexo	Sexo do paciente
diagnostico_covid19	Confirmação de COVID-19
asma	Paciente apresenta esse fator de risco (asma)
cardiopatia	Paciente apresenta esse fator de risco (cardiopatia)
diabetes	Paciente apresenta esse fator de risco (diabetes)
doenca_hematologica	Paciente apresenta esse fator de risco (doença hematológica)
doenca_hepatica	Paciente apresenta esse fator de risco (doença hepática)
doenca_neurologica	Paciente apresenta esse fator de risco (doença neurológica)
doenca_renal	Paciente apresenta esse fator de risco (doença renal)
imunodepressao	Paciente apresenta esse fator de risco (imunodepressão)
obesidade	Paciente apresenta esse fator de risco (obesidade)
pneumopatia	Paciente apresenta esse fator de risco (pneumopatia)
puerpera	Paciente se encontra nesse estágio (puérpera)
sindrome_de_down	Paciente apresenta esse fator de risco (síndrome de down)

Notas

[11.06.2020] NOTA: As informações sobre leitos e internações em dias anteriores podem conter pequenas variações em novas versões publicadas em virtude de atualizações no banco de dados do Censo Covid.

[02.09.2020] NOTA: O arquivo do histórico de leitos e internações foi atualizado para se adequar aos critérios utilizados no Plano São Paulo.

Fontes

Casos e óbitos: SIVEP, SIMI-SP e SEADE

Leitos e internações: Censo COVID (SES) e SEADE

Encoding

Encoding dos arquivos: UTF-8

Atualizações

[20.05.20]

A partir do dia 20.05.20, combinamos os arquivos enviados à imprensa pela Secretaria de Estado de Saúde com os dados organizados pelo Sistema de Monitoramento Inteligente (SIMI-SP), cuja fonte é também a Secretaria de Estado de Saúde.

Há novas variáveis e correções em relação às versões anteriores. As variáveis existentes desde a primeira versão e seus respectivos nomes foram mantidos.

[21.05.20]

A partir do dia 21.05.20, o SEADE eliminou incosistências nos dados de casos e óbitos totais acumulados, corrigindo decréscimos eventuais entre dias consecutivos.

[08.06.20]

A partir do dia 08.06.20, o SEADE passou a publicar as informações sobre leitos destinados ao tratamento da COVID-19 e novas internações seguindo os critérios adotados pelo Plano SP.

[09.08.20]

O arquivo de casos, óbitos e doenças pré-existentes será disponibilizado em formato .zip a partir desta data por ultrapassar o limite de tamanho de arquivos do github.

[22.08.20]

Inclusão do arquivo de casos, óbitos e raça/cor. Atualização dos dicionários das bases de casos, óbitos e doenças pré-existentes e de casos, óbitos e raça/cor. Inclusão de variáveis de taxa de ocupação de leitos e pacientes internados por DRS (média de 7 dias) no arquivo de Leitos e Internações.

[09.10.20]

Para acompanhar as mudanças do Plano São Paulo, adicionamos uma segunda versão do arquivo de leitos e internações com a nova regionalização da Grande São Paulo, reagrupada, e as variáveis calculadas para períodos de 28 dias.

[06.11.20]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 06 de Novembro de 2020 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[07.11.20]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 07 de Novembro de 2020 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[08.11.20]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 08 de Novembro de 2020 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[09.11.20]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de Novembro de 2020 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[10.11.20]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de Novembro de 2020 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[11.11.20]

A SES-SP retomou a extração de dados após normalização dos dados do sistema federal SIVEP, onde ocorre a notificação de casos graves e óbitos

Os dados foram atualizados na manhã do dia 11.11.20, após normalização do sistema de notificação do Ministério da Saúde que esteve inacessível desde a última sexta-feira (6) por problemas técnicos, segundo o governo federal.

Mais informações em https://www.saopaulo.sp.gov.br/noticias-coronavirus/sp-registra-399-mil-obitos-e-115-milhao-casos-de-coronavirus/

[13.11.20]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de Novembro de 2020 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[11.03.21]

Incluímos nos arquivos de leitos e internações as informações sobre pacientes, leitos e ocupação de leitos relativos a Covid-19 do útimos dia, ademais das médias móveis dos últimos 7 dias

[27.05.21]

Em razão de atualizações no sistema de organização de dados do Censo Covid, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações não foram disponibilizados hoje, 27/maio.

[28.05.21]

Em virtude de indisponibilidade do e-SUS Notifica, ferramenta online de registro de casos de COVID-19 do Ministério da Saúde, há uma variação atípica no número de novos casos em 28/maio.

[29.05.21]

Em razão de atualizações no sistema de organização de dados do Censo Covid, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações não foram disponibilizados hoje, 29/maio.

[30.05.21]

Em razão de atualizações no sistema de organização de dados do Censo Covid, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações não foram disponibilizados hoje, 30/maio.

[31.05.21]

Em razão de atualizações no sistema de organização de dados do Censo Covid, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações não foram disponibilizados hoje, 31/maio.

[01.06.21]

Em razão de atualizações no sistema de organização de dados do Censo Covid, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações não foram disponibilizados hoje, 01/junho.

[02.06.21]

Em razão de atualizações no sistema de organização de dados do Censo Covid, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações não foram disponibilizados hoje, 02/junho.

[17.07.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos em 17/Julho/2021 por indisponibilidade dos dados.

[12.11.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos em 12/Dezembro/2021 por indisponibilidade dos dados.

[14.11.21]

Em razão de problemas de instabilidade na rede externa do SEADE, os indicadores sobre ocupação de leitos, pacientes e internações foram disponibilizados hoje, 14/nov/21, após as 18h30.

[11.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dias 11 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[12.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 e 12 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[13.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11, 12 e 13 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[14.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11, 12, 13 e 14 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[15.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 15 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[16.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 16 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[17.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 17 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[18.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 18 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[19.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 19 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[20.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 20 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[21.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 21 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[22.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 22 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[23.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 23 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[24.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 24 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[25.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 25 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[26.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 26 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[27.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 27 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[28.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 28 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[29.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 29 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[30.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 30 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[31.12.21]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 a 30 de Dezembro de 2021 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[01.01.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 de Dezembro de 2021 a 01 de Janeiro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[02.01.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 de Dezembro de 2021 a 02 de Janeiro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[03.01.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 11 de Dezembro de 2021 a 03 de Janeiro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[28.01.22]

Em razão de alteração nas informações no sistema federal de notificação de dados de Covid-19, os dados de casos e óbitos foram alterados às 17h, após a atualização realizada hoje, 28 de Janeiro, às 14:00h.

[31.01.22]

[07.02.22]

A partir de 07.02.2022, o arquivo de casos e óbitos passa a ser publicado sem as seguintes variáveis: dia, mes, pop_60, area, map_leg, map_leg_s, latitude, longitude.

As colunas excluídas continuarão a ser publicadas em um arquivo compactado disponível no link: AQUI.

[11.04.22]

Em razão de alteração nas informações no sistema federal de notificação de dados de Covid-19, os dados de casos e óbitos foram alterados às 19h, após a atualização realizada hoje, 11 de abril, às 15h.

[22.05.22]

Não houve atualização das informações nos dias 21 e 22 de Maio de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[03.06.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 03 de Junho de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[04.06.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 03 e 04 de Junho de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[05.06.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 03 a 05 de Junho de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[06.06.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 03 a 06 de Junho de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[14.06.22]

Não houve atualização das informações no dia 14 de Junho de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[11.07.22]

A partir de 11.07.2022, o arquivo de casos e óbitos passa a ser publicado sem as seguintes variáveis: cod_ra, nome_ra.

As colunas excluídas continuarão a ser publicadas em um arquivo compactado disponível no link: AQUI.

[11.08.22]

Não houve atualização das informações no dia 11 de Agosto de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[29.09.22]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 28 e 29 de Setembro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[30.09.22]

Não houve atualização das informações de óbitos entre os dias 28 e 30 de Setembro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[16.10.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 16 de Outubro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[20.10.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 20 de Outubro de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[21.10.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 20 e 21 de Outubro de 2022 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[29.10.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 29 de Outubro de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[30.10.22]

A partir de 30.10.2022, o arquivo de casos e óbitos passa a ser publicado sem a seguinte variável: letalidade.

As colunas excluídas continuarão a ser publicadas em um arquivo compactado disponível no link: AQUI.

[09.12.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de Dezembro de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[10.12.22]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 10 de Dezembro de 2022 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19. As informações de casos e óbitos referentes ao dia 09 de Dezembro de 2022 foram atualizadas.

[01.01.23]

Não houve atualização das informações no dia 01 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[10.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos no dia 10 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[11.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 e 11 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[12.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 a 12 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[13.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 a 13 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[14.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 a 14 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[15.01.23]

Não houve atualização informações de casos e óbitos em 15 de Janeiro de 2023, e de óbitos entre 10 e 14 de Janeiro de 2023, em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[16.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 a 16 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[17.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 a 17 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[18.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 10 a 18 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[21.01.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 21 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[22.01.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 21 e 22 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[23.01.23]

Não houve atualização das informações de óbitos nos dias 21 a 23 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas no sistema federal de notificação de dados da Covid-19.

[28.01.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 28 de Janeiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[18.02.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 18 de Fevereiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[19.02.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 19 Fevereiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19. As informações de casos e óbitos referentes ao dia 18 de Fevereiro de 2023 foram atualizadas.

[20.02.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 20 Fevereiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19. As informações de casos e óbitos referentes ao dia 19 de Fevereiro de 2023 foram atualizadas.

[21.02.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos nos dias 20 e 21 de Fevereiro de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[01.03.23]

A partir de 08.03.23, as atualizações dos arquivos anteriormente referidos não serão mais disponibilizados via GitHub, e serão disponibilizados somente via Repositório do SEADE.

A partir de 01.03.23, o arquivo de casos e óbitos passa a ser publicado sem as seguintes variáveis: casos_pc, obitos_pc, nome_drs, cod_drs.

As colunas excluídas continuarão a ser publicadas no arquivo informado acima: AQUI link para arquivo no Repositório do SEADE.

[06.03.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 06 de Março de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[10.03.23]

A partir de 11 de março de 2023 os conjuntos de dados não serão atualizados nos finais de semana e feriados. Os dados não publicados serão incluídos no dia útil subsequente.

[15.03.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 15 de Março de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[27.03.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 25 a 27 de Março de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[09.05.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de maio de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[07.06.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de maio de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[13.06.23]

Não houve atualização das informações de casos e óbitos no dia 09 de maio de 2023 em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19.

[16.06.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 16/06/2023.

[23.06.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 23/06/2023.

[18.07.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 18/07/2023.

[25.07.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 25/07/2023.

[07.08.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 07/08/2023.

[21.08.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 21/08/2023.

[24.08.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 24/08/2023.

[29.08.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 29/08/2023.

[11.09.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 11/09/2023.

[14.09.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 14/09/2023.

[08.11.23]

Em virtude de problemas nos sistemas de dados da Covid-19, não houve atualização das informações em 08/11/2023.

Informações adicionais

Atualização: diária, definida pelo horário de recebimento dos dados.

Autoria: Fundação SEADE

Dúvidas, críticas e sugestões sobre os dados de casos e óbitos municipais: https://www.seade.gov.br/contato/

Por favor, pedimos a gentileza para que solicitações de dados não disponibilizados neste repositório sejam enviadas diretamente às fontes primárias.

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Ocupação de UTIs ao longo do tempo

Parabens pelo trabalho fantastico com os paineis.

Estou precisando de informações de ocupação de UTIs no estado e região metropolitana de SP ao longo do tempo, diariamente. Não consegui achar essa base. Vocês teriam esses dados disponíveis?

Muito obrigado desde já!

arquivo casos obitos e doenças pre-existentes: linhas faltantes?

O número de linha do arquivo casos_obitos_doencas_preexistentes.csv, que estava na ordem de 1,5 milhão, passou para menos de metade disto a partir do dia 16/01/2021.

Último commit com número acima de um milhão parece ser o 89c35a9 de 15/01/2021 (1.542.382 linhas ). O master de hoje (21/01/2021) tem 607.354 linhas.

Ocupação UTI / Idade

Diante do cenário de mudança epidemiológica da população mais afetada, seria possível incluir dados de ocupação de uti por faixa etária ?

Arquivo Casos e Óbitos

CSV com dados repetidos

O arquivo csv disponibilizado repete os dados inúmeras vezes.
Sempre que a lista de cidades acaba, a lista recomeça com os mesmos dados, mesmo dia (mês como NA) e mesmos números de casos e mortes.
Deveriam ser os dados de dias anteriores?

como criar a visualização em Power BI

olá! encontrei esssa visualização e vi que foi feita em power bi e é justamente esse tipo de modelo que preciso aplicar na minha empresa, poderia me informar como ele foi construido? ajudaria muito pois pretendo usar esse modelo como base
meu email: [email protected]

semana epidemiológica

Olá! Os dados referentes as semanas epidemiológicas, no arquivo csv, estão apresentando informações indefinidas a partir da virada do ano. Desde já agradeço,
Luiz

Internações e UTI descontinuada?

Senhores, desde o dia 28/maio/2021 que os dados não são atualizados... Alguém tem uma dica do que acontece pls?

Isolamento social

Olá!

Vocês poderiam adicionar às bases o isolamento social também? Não achei nos dados.
Estou montando um estudo de causalidade e precisava dessas informações.

Obrigado!

Clarificação de licença de reuso

Caros,

Primeiramente, parabéns pelo trabalho.

Gostaria de reutilizar os dados em outros projetos. Em especial, iniciei e tento manter atualizada a página da Wikipédia sobre a pandemia no Estado:

https://pt.wikipedia.org/wiki/Pandemia_de_COVID-19_no_estado_de_S%C3%A3o_Paulo

Os dados daqui poderiam ser automaticamente integrados ao Wikidata (https://www.wikidata.org/wiki/Wikidata:WikiProject_COVID-19), onde eles são disponibilizados em domínio público.

Os dados aqui disponibilizados estão em domínio público? Posso utilizá-los à vontade?

Obrigado!

Abraços,

Tiago

Comorbidades com status IGNORADO

Boa noite,
O arquivo casos_obitos_doencas_preexistentes.csv possui muitas linhas com a informação "IGNORADO" nas colunas de comorbidades. Como deve ser interpretado isso? Vi que um número enorme de linhas está com essas informações. Vendo o excel deu a entender que o ideal seria ser preenchido com "SIM" ou "NÃO" para podermos afirmar com total certeza se havia ou não a comorbidade. Alguns registros de linha está com todas comorbidades com "IGNORADO" mas apenas uma coluna com "SIM", isso acaba me levando a entender que o agente que inseriu o dado no sistema apenas marcou a comorbidade no caso em que há, e as outras que não há acabou deixando vazio e consequentemente aparece como IGNORADO. Também há casos em que todas comorbidades está com "IGNORADO", poderia me levar a inferir que o agente deixou o campo em branco ao preencher no sistema e consequentemente seria uma pessoa sem comorbidades? Acredito que possa haver uma falta de padronização nos procedimentos de inserção de dados nos sistemas.
Agradeço muito se conseguir algum esclarecimento, pois, com tantos casos com o status "IGNORADO" fica difícil de fazer uma análise dos dados.

Error in tolower(munic) : object 'munic' not found

Prezados, sabem me dizer o motivo deste erro? Ocorre ao rodar a função

info_munic <- read.csv2('data/informacoes_municipais_seade.csv') %>%
mutate(munic = tolower(munic),
munic = remove_acentos(munic),
munic = trimws(munic),
munic = str_replace_all(munic, '-', ' '))

Já coloquei os 3 arquivos na pasta corretamente mas o problema persiste.

Att,

Henrique

Casos acumulados e óbitos em São Paulo em 30/05

Estou pegando os dados diretamente do site federal https://covid.saude.gov.br/.
Vi que para a cidade de São Paulo o número de casos acumulados está em 114.360.
O mesmo ocorre para o número de óbitos na cidade: 8.355.
Ao baixar o arquivo e fazer os filtros encontrei esses números acima.

No painel do estado o número parece estar correto.

Novos casos/óbitos por dia

Olá. Gostaria de saber se não há possibilidade de disponibilizar os dados referentes aos casos novos e óbitos por dia, por município, como é disponibilizado no SEADE. Como ele unifica essa informação de todos os municípios do estado seria de grande ajuda, porém não disponibiliza isso em .csv ou .tsv.

Divergência de dados Seade x prefeitura de SP

Olá, Leo, tudo bom?
Primeiro parabéns pelo repositório de dados de Covid-19, é muito útil para nossas análises.
Gostaria de entender porque os dados de casos (esus+sivep), especificamente, filtrados por data de notificação de 1 a 11 de janeiro, e por confirmação laboratorial para Covid, estão inferiores aos extraídos pela prefeitura da capital nos mesmos sistemas com os mesmos filtros. Pode estar havendo algum tipo de extração incompleta dos sistemas e-sus e/ou sivep que faça com que os dados extraídos por vocês nesses dias seja inferior aos extraídos pela prefeitura? O que pode estar motivando?
Obrigada!

Cidade Faltante no Relatório Dados Covid

Boa tarde, parabéns pelo trabalho.

Apenas gostaria de alertar alem dos casos IGNORADOS nos 3 relatórios dados_covid-sp faltam uma cidade São Luis do Paratinga

E desculpa pela minha ignorância, mas não pude entender o cálculo para as colunas casos_mm7d e obitos_mm7d.

Muito obrigado.
Sidney Pino

Status dos indicadores - Classif. vigente (fase do grau de flexibilidade da região)

@leobarone parabéns pelo trabalho, uma grande ajuda nos projetos.

Gostaria de calcular a fase das regiões de são paulo, mas não estou conseguindo pegar todas as variáveis, gostaria de ver se há possibilidade de incluir no arquivo "plano_sp_leitos_internacoes.csv" esse dado;

segue a formula para cacular a fase:

Dicionário para o arquivo de Casos, óbitos e doenças pré-existentes

Bom dia, tudo bom?

Primeiramente, parabéns pelo trabalho! Estes dados estão me ajudando bastante no meu TCC :)

Gostaria de saber se é possível inserir uma coluna nova neste conjunto contendo a “data de óbito”, pois neste conjunto só possui a “data de início de sintomas” e, eu gostaria dessa data de óbito para elaborar um gráfico de linha temporal.

Eu vi que vocês possuem um conjunto somente com óbitos, mas este conjunto só apresenta a somatória de óbitos por município, e eu precisaria de óbito por indivíduo.

Atualização 15.jul e Série Histórica para Ocupação de UTIs

@leobarone parabéns pelo trabalho de vocês, ajuda bastante nas projeções.
Tenho duas dúvidas:

o que houve com a atualização de 15/07? Há previsão para a disponibilidade?
onde posso obter a série histórica com os dados diários de "Ocupação Leitos Covid" por regional de saúde (DRS)?

Obrigado desde já pelo apoio.

Dados de casos e óbitos

Os dados referentes a casos e óbitos foram descontinuados?

Leitos e internações por MUNICÍPIO

Boa tarde.
Poderia passar a disponibilizar uma base semelhante à "plano_sp_leitos_internacoes_serie_nova_variacao_semanal.csv", mas por município ao invés de DRS?
Grato.

Arquivo casos_obitos_doencas_preexistentes

Oi Pessoal,

A atualização desse arquivo casos_obitos_doencas_preexistentes.csv.zip foi descontinuada?

Dados de ocupação de UTI

Primeiramente, parabéns pela iniciativa de publicação dos dados!

Issue:
O painel apresenta o dado de ocupação das UTIs, mas os arquivos de dados aparentemente não tem a informação da quantidade de UTIs ocupadas. Também não há dados sobre leitos de enfermaria ocupados ou totais.

Seria possível disponibilizar também estes dados para acompanhamento da série histórica?

Outro comentário referente ao mesmo assunto:
A descrição da coluna "total_covid_uti" (Total de Leitos de UTI Destinados para COVID-19 no dia) não deixa claro se é o número de UTIs que foram "destinadas à pacientes de COVID naquele dia" (ou seja, foram efetivamente ocupadas por pacientes de COVID), ou se são "reservadas" para pacientes de covid (e portanto incluiriam todos os leitos de UTI, incluindo ocupados e não ocupados).
Meu entendimento foi de que se trata do total reservado (incluindo ocupados e não ocupados).
Porém este dado não está batendo com o relatório do Plano São Paulo de 3/6 que apresenta na penúltima página 4693 leitos destinados à COVID no estado. A base de dados tem o número 7192 neste dia. Gostaria de confirmar a informação.

Números variável `cod_drs`

Olá!
Estou com dúvida sobre o padrão que a variável cod_drs do banco dados_covid_sp.csv segue.
Os números não batem com os códigos dos DRS do site da Secretaria de Estado da Saúde , http://www.saude.sp.gov.br/ses/institucional/departamentos-regionais-de-saude/regionais-de-saude.

Muito obrigada e parabéns pelo trabalho!

Arquivo csv com dado incorreto

Na linha 1018 do arquivo csv há uma entrada para a cidade de São Paulo no dia 09/04 fora da ordem alfabética e com a contagem muito diferente das outras.
E há uma outra entrada para cidade na mesma data n linha 1035.

A da linha 1018 é um erro, não?
Vocês poderiam removê-la?

Casos, óbitos e doenças pré-existentes: colunas com todas as observações IGNORADO

Prezados, boa tarde,
Na data de hoje, 22/09/2021, ao trabalhar com o banco de dados "Casos, óbitos e doenças pré-existentes" notei que as as colunas asma, doenca_hematologica, doenca_hepatica, doenca_neurologica, obesidade, outros_fatores_de_risco, pneumopatia, puerpera e sindrome_de_down estão vindo com todas as observações como IGNORADO, acredito que seja um erro pois já utilizei as mesmas para ajustar um modelo em Maio de 2021.

'data_inicio_sintomas': datas faltando (dias superiores a 12)

Ao verificar a quantidade de datas diferentes no campo 'data_inicio_sintomas' dos dados em https://github.com/seade-R/dados-covid-sp/blob/master/data/casos_obitos_doencas_preexistentes.csv.zip, notei que existem apenas 179 datas diferentes, muito inferior aos ~400 dias de pandemia.

Notei também que não tem nenhum dia superior a 12.

Até uns 4 dias atrás, eu usei os dados e esse erro não ocorria.

Código em Python para reproduzir:

import pandas as pd
fileurl = 'https://github.com/seade-R/dados-covid-sp/blob/master/data/casos_obitos_doencas_preexistentes.csv.zip?raw=true'
df = pd.read_csv(fileurl, encoding='ISO-8859-1', sep=';', compression='zip')
df[['data_inicio_sintomas']].value_counts().sort_index().head(30)

Saída do código:

2020-01-03                337
2020-01-04               1914
2020-01-05               4541
2020-01-06               9471
2020-01-07              11896
2020-01-08               9655
2020-01-09               7386
2020-01-10               4945
2020-01-11               4939
2020-01-12               9715
2020-02-03                104
2020-02-04               1196
2020-02-05               2766
2020-02-06               5952
2020-02-07               8876
2020-02-08               6539
2020-02-09               6160
2020-02-10               3877
2020-02-11               4246
2020-02-12               7559
2020-03-03                125
2020-03-04               1203
2020-03-05               2752
2020-03-06               5805
2020-03-07               9497
2020-03-08               8873
2020-03-09               5775
2020-03-10               3062
2020-03-11               4876
2020-03-12               7579

(Parece que as datas estão no formato ano-dia-mês)

Tentando com a versão de 30 de abril, as datas aparecem normal:

fileurl = 'https://github.com/seade-R/dados-covid-sp/blob/d6bd4c2d1160bba0136e99c69a08899034d05045/data/casos_obitos_doencas_preexistentes.csv.zip?raw=true'
df = pd.read_csv(fileurl, encoding='ISO-8859-1', sep=';', compression='zip')
df[['data_inicio_sintomas']].value_counts().sort_index().head(30)

2020-02-04               32
2020-02-05               41
2020-02-06               27
2020-02-07               14
2020-02-08               28
2020-02-09               17
2020-02-10               36
2020-02-11               24
2020-02-12               37
2020-02-13               21
2020-02-14               28
2020-02-15               53
2020-02-16               15
2020-02-17               30

Casos confirmados: somente por RT-PCR, por sorológico ou ambos?

Olá, Leo Barone!

Tudo bem? Estou trabalhando com algumas tabelas de sua (muito boa) base de dados, porém estou com algumas dúvidas em alguns pontos; um deles é na tabela "casos_obitos_doencas_preexistentes.csv". Essa tabela, em tese, abriga somente casos confirmados de COVID-19. Como se deu essa confirmação? Através de RT-PCR, de teste sorológico (rápido ou não), uma mistura dos dois ou essa informação é ignorada? Muito obrigado pela atenção!

[]s,

Marcelo

Casos Mogi-mirim

De acordo com os prints dos boletin epidemiologico da secretaria, todos diferem dos dados demonstrados.
dia 08/06 - 75 confirmados
dia 18/06 - 120 confirmados
dia 09/07 - 303 confirmados

nos dados, acumuladamente até o dia 06/07 tinham somente 49 casos, então no dia 07/07 reportaram 207 casos.
parece que fizeram um catado e informaram os dados agrupados, o que gera um crescimento semanal espantoso, quando na verdade não houve.

CASOS DE Óbitos e doenças pré-existentes (Arquivo incompleto)

Olá, Parece que o arquivo casos_obitos_doencas_preexistentes.csv.zip (23/04/2021) veio incompleto dessa vez.

Além do formato da data ter sido alterado (antes aaaa-mm-dd e agora aaaa-dd-mm), as datas vão somente até o dia 12 de cada mês a partir do mês... Eu acredito que isso aconteceu pela confusão com a troca do formato da data.

Está faltando dados no arquivo de leitos e internações

Lista das informações que faltam:

pacientes_uti_mm7d
ocupacao_leitos

Dados por bairros

Bom dia,

Primeiramente gostaria de agradecer pela disponibilização dos dados, é bem importante termos essa transparência nesse momento.

Gostaria de saber se existe alguma fonte de dados que indiquem os casos por bairro ou o mais próximo disso. Teria?

Agradeço desde já.

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