pydicomを用いてDICOM RTを解析するときのツール群です。
以下の方法で変数ctに3次元Volumeを読み込みます。
from pydicom_tools import CTImage
ct = CTImage()
ct.load(path_to_ct)以下の方法でDRRを生成します。 DRRの作成にはITKが必要です。事前にpipなどでインストールしてください。
pip install itkfrom pydicom_tools import DRR
drr = DRR(ct, beam, size)ctはCTImageクラスのインスタンス、beamはBeamSequenceのオブジェクト、
sizeはDRRのmm単位のサイズです。
以下の方法でRT Structure Setを読み込みます。
from pydicom_toos import RTSS
ss = RTSS('path/to/rtss')
# 輪郭名一覧を表示
print(ss.structures)
# z座標をkeyとする輪郭点座標の辞書へアクセス
points = ss.points['Structure Name']
# z座標をkeyとするmatplotlib.path.Pathクラスのオブジェクトへアクセス
paths = ss.paths['Structure Name']
# 輪郭の体積を計算
volume = ss.calc_volume('Structure Name')
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