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insa-gl-analyse-medicale's Introduction

Projet Génie Logiciel - Analyse médicale

license build

Presentation

Ceci est un projet fait en Génie Logiciel 3IF à l'INSA de Lyon. Le sujet est disponible ici Auteurs :

  • Marc-Antoine FERNANDES
  • Julia LU DAC
  • Lucas ONO
  • Tianhao WU
  • Ye YUAN

Utiliser l'application

Serveur

L'application serveur permet d'évaluer les maladies possibles qui peuvent être incluses dans un génôme.

Fichiers utilisés

Il s'appuie sur un fichier contenant un dictionnaire des maladies qu'il est capable d'évaluer.

Démarrage du serveur

Lorsque l'interface est lancée, un numéro de port sur lequel doit démarrer le serveur est demandé, ainsi que le nom du fichier contenant le disctionnaire de maladies. C'est le port sur lequel sera lancée l'application serveur. Ces paramètres choisis, il suffit de cliquer sur le bouton "Start Server", qui démarrera le serveur si tout fonctionne. Un serveur en exécution est capable de répondre à des requêtes de client arrivant sur son adresse IP et son numéro de port. Ces requêtes doivent concerner l'une des trois fonctions :

  • Fournir la liste des maladies du dictionnaire
  • Indiquer si un risque de maladie est présente dans un génôme
  • Fournir la liste des risques de maladie dans un génôme
Diffusion de l'adresse IP et du port via multicast

Un bouton "Start Multicast" permet au serveur d'envoyer à intervalles réguliers (2.5 s) son adresse IP et le port de connexion sur une adresse multicast, pour en informer les clients. L'adresse IP est 225.6.7.8 et le port est 5678. Le bouton "Stop Multicast" permet d'arrêter ces envois.

Quitter

Un bouton permet de quitter l'application à tout moment.

Erreurs possibles

Lorsque le fichier du dictionnaire des maladies ou que le port sur lequel vous voulez démarrer est déjà occupé, le serveur ne démarre pas et vous devrez spécifier d'autres valeurs.

Client

L'application cliente permet d'obtenir des évaluations des maladies à risque sur des génômes de patient. Pour cela, elle envoie des requêtes à des serveurs qui lui envoient la réponse.

Fichiers utilisés

Le génôme à analyser se situe dans un fichier ordinaire, et la liste des serveurs auxquels sera envoyée une requête se situe dans un fichier nommé "server.db" sous forme de base de données, à mettre dans le même répertoire que l'exécutable.

Evaluer une analyse médicale

C'est la fonction primaire de l'application. Lorsque l'on clique sur ce bouton, une fenêtre s'ouvre avec 3 boutons. Chaque bouton permet d'envoyer une requête à un ou plusieurs serveurs : *Get diseases : Vous recevrez la liste des maladies à risque que le serveur cible est capable d'évaluer. *Evaluate All Disease : Le génôme à évaluer est demandé. Vous recevrez la liste de l'ensemble des maladies à risque que les serveurs répertoriés ont trouvé sur ce génôme. *Evaluate One Disease : Le génôme à évaluer et la maladie à chercher sur ce génôme sont demandés. Vous recevrez une réponse "Yes" ou "No" lors de la présence ou non de la maladie sur le génôme.

Gestion des serveurs enregistrés

Une fenêtre s'ouvre. *Update Servers List : met à jour les serveurs répertoriés dans la base de données. *Add Server : permet d'ajouter manuellement un serveur dans la base de données. Son adresse IP et son nom sont demandés. *Remove Server : permet d'enlever manuellement un serveur répertorié de la base de données. Son adresse IP est demandée.

Quitter

Un bouton permet de fermer l'application à tout moment.

Erreurs possibles

*Impossible de lire le fichier contenant le genôme *Impossible de manipuler la base de données des serveurs répertoriés *Erreur de réseau

Contribuer

Dépendance

Configurer l'environnement

Le projet utilise cmake. Cela permet d'être compatible avec CLion, Code Blocks mais également Visual Studio.

Visual Studio

Visual Studio 15 (2017) Supporte cmake nativement !

Pour les anciennes versions de VS, cmake permet de générer les fichiers de configuration :

mkdir _cmake_vs_build
cd _cmake_vs_build/
cmake .. -G "Visual Studio 14 Win64"

Après ça, des fichiers de solutions Visual Studio devraient être créés

CLion

CLion prend en charge nativement les projets cmake, donc il suffit de cloner le repo et ouvrir le projet.

Lancer les tests unitaires

Les tests unitaires sont déjà configurés dans le CMakeLists.txt.

Licence

Copyright (C) 2017 Marc-Antoine FERNANDES, Julia LU DAC, Lucas ONO, Tianhao WU, Ye YUAN

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Contributors

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