linhandev / dataset Goto Github PK

数据集名称*：
标注内容*（标注的器官/病灶）：
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：
类型（分类/分割/检测/...）：
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

希望添加 方向数据集。
相关方向介绍：

数据集名称*：Early Breast Cancer Core-Needle Biopsy WSI (BCNB) Dataset，早期乳腺癌患者的穿刺活检WSI
标注内容*（标注的器官/病灶）：在早期乳腺癌患者的病理WSI中，标注了部分的肿瘤区域，并提供了一些临床信息（age, tumor size, tumor type, ER, PR, HER2, HER2 expression, histological grading, surgical, Ki67, molecular subtype, number of lymph node metastases, label）
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：https://github.com/bupt-ai-cz/BALNMP#license
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://bupt-ai-cz.github.io/BCNB/
类型（分类/分割/检测/...）： 分类
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：1058
标签格式：Excel
文件格式：JPG, Excel

请问肺部多病种的天池数据集可以下载吗？
比赛过后似乎看不到数据集了。
盼复
感谢

数据集名称*：OASIS-3
数据集官网*：https://www.oasis-brains.org/#data
标注内容*（标注的器官/病灶）： 脑
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://www.oasis-brains.org/#data
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）： 配准
模态（CT/MR/CXR/...）： 多模态
数量（扫描总数/图片张数）：不用全下，看看能不能下T1和T2就好，谢谢
标签格式：
文件格式：

数据集名称*：Low Dose CT Image and Projection Data (LDCT-and-Projection-data)
标注内容*（标注的器官/病灶）： 肺等
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=52758026
类型（分类/分割/检测/...）： 重建
模态（CT/MR/CXR/...）： CT
数量（扫描总数/图片张数）： 未知
标签格式：
文件格式：

https://github.com/MIRACLE-Center/CTPelvic1K

希望添加 方向数据集。
相关方向介绍：

数据集名称*：SUN-SEG
标注内容*（标注的器官/病灶）： 结肠镜视频 息肉分割
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：
https://github.com/GewelsJI/VPS/blob/main/docs/DATA_PREPARATION.md
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： 视频
数量（扫描总数/图片张数）： 1,106个结肠镜视频片段（158,690视频帧）
标签格式： 二值化掩膜（*.PNG）
文件格式： 视频格式

希望添加髋关节标注了股骨和髋臼方向数据集。
相关方向介绍：股骨和髋臼中间只有一个很窄的组织，需要将这2部分分离出来，但是没有找到可以学习的数据集

请填写数据集基本信息，*为必填项，其他内容请尽量填写．

注：开 Issue 后数据集成功并入项目，您的Github ID不会作为项目合作者在项目主页展示，我们会在项目末尾致谢．如果您希望作为项目合作者被展示请提交PR．

数据集名称*：STARE
标注内容*（标注的器官/病灶）： 眼底血管分割
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：https://cecas.clemson.edu/~ahoover/stare/
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://cecas.clemson.edu/~ahoover/stare/
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： 光学
数量（扫描总数/图片张数）： 400
标签格式：
文件格式：

请填写数据集基本信息，*为必填项，其他内容请尽量填写．

注：开 Issue 后数据集成功并入项目，您的Github ID不会作为项目合作者在项目主页展示，我们会在项目末尾致谢．如果您希望作为项目合作者被展示请提交PR．

数据集名称*：CHASE_DB1
标注内容*（标注的器官/病灶）： 眼底
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：https://blogs.kingston.ac.uk/retinal/chasedb1/
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://blogs.kingston.ac.uk/retinal/chasedb1/
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： 光学
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

希望添加尿道 方向数据集。

TUH EEG信号v1.5.2：
标注内容：癫痫类别
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*：数据集官网https://isip.piconepress.com/projects/tuh_eeg/html/downloads.shtml
网盘链接: https://pan.baidu.com/s/1bAqp-sEGGPVdYEK5AsJ4ng 密码: nh8r
类型：分类
数量：总发作数: 2377
标签格式：癫痫发作类别（FNSZ/GNSZ/SPSZ/CPSZ/ABSZ/TNSZ/CNSZ/TCSZ/ATSZ/MYSZ）
文件格式：edf

数据集名称*：TubeTK
数据集官网*：https://public.kitware.com/Wiki/TubeTK/Data
标注内容*（标注的器官/病灶）： 大脑，颅内血管
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://data.kitware.com/#collection/591086ee8d777f16d01e0724
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： MRA
数量（扫描总数/图片张数）： 100
标签格式
文件格式：

希望添加 方向数据集。
相关方向介绍：

数据集名称*：磁共振MRT2腰椎矢状位椎体和椎间盘分割数据
标注内容*（标注的器官/病灶）： 10个椎骨和9个椎间盘
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：暂不知道
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：比赛官方网址https://www.spinesegmentation-challenge.com/。aistudio:https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/81211
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： MRT2WI
数量（扫描总数/图片张数）： 172
标签格式： NIFIT
文件格式：NIFIT

数据集名称*：MRbrainS13
数据集官网*：https://mrbrains13.isi.uu.nl/
标注内容*（标注的器官/病灶）： write matter, gray matter, CFS
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://mrbrains13.isi.uu.nl/
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）：MR
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

请填写数据集基本信息，*为必填项，其他内容请尽量填写．

注：开 Issue 后数据集成功并入项目，您的Github ID不会作为项目合作者在项目主页展示，我们会在项目末尾致谢．如果您希望作为项目合作者被展示请提交PR．

名称*：
标注内容*（标注的器官/病灶）：
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE写名字，如果是Custome LICENSE写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：
类型（分类/分割/检测/...）：
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

数据集名称*：Duke-Breast-Cancer-MRI
标注内容*（标注的器官/病灶）： 乳腺癌病变
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：开放协议
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=70226903
类型（分类/分割/检测/...）： 预测
模态（CT/MR/CXR/...）： MRI
数量（扫描总数/图片张数）： 922
标签格式：
文件格式：

数据集名称*：Osirix DICOM image sample sets
标注内容*（标注的器官/病灶）： 心脏，脑部，肺等
LICENSE*：
下载方式*：http://www.osirix-viewer.com/resources/dicom-image-library/
类型（分类/分割/检测/...）： 显示
模态（CT/MR/CXR/...）：CT
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

请问是否有录制了一段超声视频，然后根据视频进行诊断分类的数据集呢？

数据集名称*：由 Hamlyn 医学中心提供的开源视频数据集
数据集官网*：http://hamlyn.doc.ic.ac.uk/vision/
标注内容*（标注的器官/病灶）： 内腔
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：http://hamlyn.doc.ic.ac.uk/vision/
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）：
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

希望添加 方向数据集。
相关方向介绍：

数据集名称*：MEDHSI databas
数据集官网*：https://bio-hsi.ecnu.edu.cn/accounts/login/?next=/
标注内容*（标注的器官/病灶）： 胆管
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：官网注册下载，但是我目前注册不了，不知道为什么
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）： 分类
模态（CT/MR/CXR/...）： HSI（高光谱）
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

CT Images in COVID-19有一个part 2的更新，现在AIStuido上只有part 1

https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+Images+in+COVID-19#70227107bcab02c187174a288dbcbf95d26179e8

数据集名称*：全腹部器官数据集WORD
标注内容*（标注的器官/病灶）： 肝、脾脏、肾(L)、肾(R)、胃、胆囊、食管、胰腺、十二指肠、结肠、肠、肾上腺(L)、肾上腺(R)、直肠、膀胱、股骨头(L)和股骨头(R)
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：GNU General Public License v3.0.
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://pan.baidu.com/s/1mXUDbUPgKRm_yueXT6E_Kw https://drive.google.com/drive/folders/16qwlCxH7XtJD9MyPnAbmY4ATxu2mKu67?usp=sharing
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： CT
数量（扫描总数/图片张数）：该数据集包含150个腹部CT体积（30495片）。每卷有16个器官，具有精细的像素级注释和基于涂鸦的稀疏注释，这可能是最大的具有全腹部器官注释的数据集。
标签格式： 像素级注释 nii.gz格式
文件格式： nii.gz格式

希望添加 方向数据集。
相关方向介绍：

数据集名称*：PanNuke
数据集官网*：https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/
标注内容*（标注的器官/病灶）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/pannuke
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： 图片
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：
从官网下载的数据集的掩码文件中缺少type文件，导致mask无法正常生成，图片可以生成，希望可以帮我解决这个问题，谢谢

这个是个超声心动图数据集

数据集名称*：lung vessel segmentation (vessel12)
标注内容*（标注的器官/病灶）： lung vessel
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：https://tianchi.aliyun.com/dataset/dataDetail?dataId=94812
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的)https://tianchi.aliyun.com/dataset/dataDetail?dataId=94812
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： CT
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

请填写数据集基本信息，*为必填项，其他内容请尽量填写．

注：开 Issue 后数据集成功并入项目，您的Github ID不会作为项目合作者在项目主页展示，我们会在项目末尾致谢．如果您希望作为项目合作者被展示请提交PR．

数据集名称*：
标注内容*（标注的器官/病灶）：
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：
类型（分类/分割/检测/...）：
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

数据集名称*：TCGA-LUAD，TCGA-LUSC肺癌影像学数据集
标注内容*（标注的器官/病灶）：胸部，肺部
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://wiki.cancerimagingarchive.net/plugins/servlet/mobile?contentId=16056484#content/view/16056484

https://wiki.cancerimagingarchive.net/plugins/servlet/mobile?contentId=6881474#content/view/6881474

类型（分类/分割/检测/...）：分类
模态（CT/MR/CXR/...）： CT
数量（扫描总数/图片张数）： 103个病例
标签格式：
文件格式：

希望添加 方向数据集。
相关方向介绍：

数据集名称*：IDC 乳腺组织病理学图像
标注内容*（标注的器官/病灶）：乳腺组织
LICENSE*：https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://www.kaggle.com/datasets/paultimothymooney/breast-histopathology-images
类型（分类/分割/检测/...）：分类
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）： 162
标签格式：
文件格式：png

例如LIDC-IDRI.zip.007下载下来文件是00$x格式，无法解压。不清楚原因

数据集名称*：MRbrainS18
数据集官网*：mrbrains18.isi.uu.n
标注内容*（标注的器官/病灶）： 脑
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：mrbrains18.isi.uu.n
LICENSE（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
类型（分类/分割/检测/...）： 分割
模态（CT/MR/CXR/...）： MR
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

BraTS是脑部的数据集，或许应该分类在脑下面？

数据集名称*：Sipakmed
标注内容*（标注的器官/病灶）： 宫颈异常上皮细胞（单细胞图像与整张巴氏幻灯片图像）
LICENSE*：https://www.cs.uoi.gr/~marina/sipakmed.html
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://www.cs.uoi.gr/~marina/sipakmed.html
类型（分类/分割/检测/...）： 分类

数据集名称*：Herlev
标注内容*（标注的器官/病灶）： 宫颈异常上皮细胞（单细胞图像）
LICENSE*：https://mde-lab.aegean.gr/index.php/downloads
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://mde-lab.aegean.gr/index.php/downloads
类型（分类/分割/检测/...）： 分类/分割

数据集名称*：阿里天池[“数字人体”视觉挑战赛-宫颈癌风险智能诊断]
标注内容*（标注的器官/病灶）： 宫颈异常上皮细胞（TCT检测图像）
LICENSE*：(https://tianchi.aliyun.com/markets/tianchi/VisualChallenge)
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://blog.csdn.net/abyss_miracle/article/details/104720413
链接包括kfb图片读取器等的下载
类型（分类/分割/检测/...）： 检测（2分类）

数据集名称*：CRIC Searchable Image Database
标注内容*（标注的器官/病灶）： 宫颈异常上皮细胞（巴氏检测图像），标注了细胞的中心点坐标
LICENSE*：文章链接(https://www.nature.com/articles/s41597-021-00933-8)
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://cricdatabase.com.br
类型（分类/分割/检测/...）： 分类（从中心点裁剪出90*90像素大小的单细胞图像）

数据集名称*：mendeley lbc
标注内容*（标注的器官/病灶）： 宫颈异常上皮细胞（TCT幻灯片）
LICENSE*：CC BY 4.0
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://data.mendeley.com/datasets/zddtpgzv63/4
类型（分类/分割/检测/...）： 分类

iseg2019
请问能否提供iseg2019的Aistudio下载连接？下载那里只提供了国外网址的，没有Aistudio
谢谢！

数据集名称*：
标注内容*（标注的器官/病灶）： 鼻窦
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：
类型（分类/分割/检测/...）：
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

如题。
ISBI细胞跟踪的Aistudio下载链接显示：获取数据集详情失败: 没有权限

Thanks for your great job! Some digital pathology image data sets may be helpful, such as Camelyon or DigestPath, etc.

请填写数据集基本信息，*为必填项，其他内容请尽量填写．

注：开 Issue 后数据集成功并入项目，您的Github ID不会作为项目合作者在项目主页展示，我们会在项目末尾致谢．如果您希望作为项目合作者被展示请提交PR．

数据集名称*：冠脉CTA
标注内容*（标注的器官/病灶）： 冠状动脉
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：https://zenodo.org/record/3819799#.YKccAUQzbIU
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://asoca.grand-challenge.org/
类型（分类/分割/检测/...）分割
模态（CT/MR/CXR/...）： CT
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

希望添加 OASIS脑部 方向数据集。
相关方向介绍：
请问有没有OASIS脑部数据集，这是网站的地址https://www.oasis-brains.org/，但是无法提交申请。

数据集名称*：RibFrac
标注内容*（标注的器官/病灶）： 肋骨骨折的自动检测和分类
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：http://www.apache.org/licenses/
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://ribfrac.grand-challenge.org/
类型（分类/分割/检测/...）：
模态（CT/MR/CXR/...）：
数量（扫描总数/图片张数）：
标签格式：
文件格式：

相关方向介绍：
The Fetal Brain Tissue Annotation and Segmentation Challenge (FeTA) is a multi-class image segmentation challenge organized as part of MICCAI 2021. ntation challenge organized as part of MICCAI 2021.

除Brast以外，请问有没有多模态MRI分类方向的数据集

请填写数据集基本信息，*为必填项，其他内容请尽量填写．

注：开 Issue 后数据集成功并入项目，您的Github ID不会作为项目合作者在项目主页展示，我们会在项目末尾致谢．如果您希望作为项目合作者被展示请提交PR．

数据集名称*：
标注内容*（标注的器官/病灶）：Spine
LICENSE*（关于数据集使用和传播的协议，常用LISENCE请写名字，如果是Custome LICENSE请写网址）：CC BY-SA 4.0 License,MIT License.
下载方式*（下载网址或介绍下载方式的网页）：https://github.com/anjany/verse
类型（分类/分割/检测/...）：Segmentation
模态（CT/MR/CXR/...）：CT
数量（扫描总数/图片张数）:
标签格式：json
文件格式：nii