Архивные материалы
- MachineConfig: полуавтоматическая конфигурация биоинформационной машины
- Scissors: Пайплайн для обработки экзомных данных
- FastContext: Инструмент для контекстного анализа ридов
| Task |
Description |
Status |
Deadline |
| Баркодирование сайтов рестрикции |
Подумать |
- |
- |
| Бенчмарк |
Запустить тулзы у нас |
- |
- |
| Мензоров |
Посмотреть кмеры в транскриптомах человека |
- |
- |
| LNCAP |
Сравнить снипы наших и контрольных данных |
- |
- |
| Презентация |
Неинвазивный пренатальный скрининг - технология, необходимые материалы и т.д. |
В процессе |
- |
| Форма информированного согласия |
для обычного экзома, генома и Exo-С |
В процессе |
- |
| Написать в этический комитет |
- |
Ожидание |
- |
| Доклад |
Взять экзом и ехос данные, разделить их на те, которые попадают в капчу, и те, которые не попадают. |
Ожидание |
- |
| Анализ |
Процент мисматчей в дорожках А и B. Посмотреть, какого хуя там ещё какие-то последовательности. |
Ожидание |
- |
| Анализ |
FR600+Illumina (если >5000 ридов с адаптером - сливаем с FR600 и смотрим) |
Ожидание |
- |
| Доработка Scissors |
Добавить пол, а также warning по покрытию Y-хромосомы |
Ожидание |
- |
| Предмет |
Отчётность |
ФИО препода |
Контакты |
Долги |
| Акушерство и гинекология |
Зачет |
Наталья Михайловна Пасман (лекции), Опарина Марина Петровна +79139190707 Дударева Алла Витальевна +79139227408 (семинар) |
|
|
| Госпитальная терапия |
Зачет |
Воротников Иван Борисович +79139029927, Летягина Елена Алексеевна +79139874558, Омельченко Виталий Олегович +7 952 916-97-49 |
|
|
| Госпитальная хирургия |
Зачет |
Вернер |
|
|
| Инфекционные болезни, эпидемиология |
Зачет |
|
|
|
| Клеточные технологии в лечении заболеваний |
Зачет |
|
|
тест, отправить на [email protected] (5 мая 2021) |
| Нейроэндокринология |
Дифференцированный зачет |
|
|
|
| Неотложные состояния, симуляционный курс |
Экзамен |
Кочетков Евгений Станиславович +79137190483 |
|
|
| Общественное здоровье и здравоохранение, экономика здравоохранения |
Дифференцированный зачет |
Майер Екатерина Олеговна |
+79139004449 |
|
| Основы гемостаза и биохимические аспекты клинической гемостазиологии |
Дифференцированный зачет |
|
|
|
| Виктор Геннадьевич Стуров |
[email protected] |
Реферат клиническая биохимия "Акушерские кровотечения: современные аспекты патогенеза, диагностика, Тактика ведения пациенток в аспекте клинических современных рекомендаций" (до 21 мая 2021, скинуть на диск) |
|
|
| Подготовка к защите и защита выпускной квалификационной работы |
Экзамен |
|
|
|
| Подготовка к сдаче и сдача государственного экзамена |
Экзамен |
|
|
|
| Поликлиническая терапия |
Дифференцированный зачет |
Чугуров Александр Степанович +79137866242, Солдатова Галина Сергеевна +79139117164, Бочкова Юлия Валерьевна +7 913 717-41-96 |
|
|
| Производственная практика, научно-исследовательская практика |
Экзамен |
|
|
|
| Профессиональные болезни |
Зачет |
Долгова Нина Анатолеьвна +79139466299 |
|
|
| Роль опухолевого микроокружения в канцерогенезе |
Зачет |
|
|
|
| Травматология, ортопедия |
Зачет |
Сорокин Артем Николаевич +79133827474 |
|
|
Tl;dr
[10/02/2021, 20:01:40]: Описания пациентов собрал в табличку, FastQ отдал ребятам из Сбера
[12/02/2021, 20:28:35]: Сделал HiC-карты для статьи
[12/02/2021, 20:29:25]: Настроил почту
[17/02/2021, 19:34:00]: Правки к статье готовы
[19/02/2021, 12:36:40]: Оформил всё к курсовой
[19/02/2021, 17:01:45]: Посчитал обогащение Exo-C-библиотеки (демультиплекс Алины)
[05/03/2021, 13:52:47]: Проанализировал микрочипы из Томска
[10/03/2021, 12:13:56]: Добавил аннотацию к микрочипам
[10/03/2021, 19:05:46]: Посчитал обогащение к получившимся образцам Exo-C
[16/03/2021, 18:54:43]: Прикрутил к пайплайну region-based аннотацию и проблемные регионы
[16/03/2021, 18:55:44]: Отправил данные двух братьев
[17/03/2021, 15:48:08]: Посчитал статики для диплома
[17/03/2021, 23:13:46]: Пересек контроль для диплома с экзомом и удивился
[17/03/2021, 23:14:09]: Валидировал варианты Exo-C библиотек
[19/03/2021, 17:21:37]: Сделал Динаре мутации
[22/03/2021, 14:53:28]: Сбер, сделал VCF аннотиванные анноваром
[26/03/2021, 21:25:15]: Сделал поздравлялочку по email
[31/03/2021, 13:44:48]: ROC-кривая для диплома
[19/04/2021, 15:13:25]: Сделал общую табличку
React
Typescript
Django
Laravel
Facebook
Microsoft
Google
Alibaba
D3
Tencent