Bien, pero puedes mejorarlo.

En el listado de avances del repo de la clase te faltó poner https://github.com/almamelisa/ProyectoFinalBioinfo-2018-II/blob/master/Avance_3.md entre paréntesis, por favor corrige esto.

No es necesario que pongas los md de los avances. Pero si quieres hacerlo, pon lo links de los avances utilizando el formato que usamos en el listado de proyectos finales, es decir Avance_1.md en vez de

Avance_1.md https://github.com/almamelisa/ProyectoFinalBioinfo-2018-II/blob/master/Avance_1.md

En data tienes que especificar y describir qué datos hay en cada folder.

importante tu script maestro TIENE RUTAS ABSOLUTAS. Como hemos visto en clase, esto no es recomendable, por lo que te pido que las sustituyas por rutas relativas. Contará para la calificación.

Correcciones inglés:

to obtain a phylogenetic -> in the data and scripts needed for obtaining a phylogenetic
The using data -> The data

Se ve buenos los datos, sin embargo, veo que en el artículo que escogiste ya se hicieron análisis filogenéticos con métodos bayesianos y que incluso hay un Dryad con los datos en los formatos necesarios para hacer esto. ¿En qué difiere tu trabajo de lo que ya se hizo en el artículo?

Muy bien. Solo se te fue poner en formato código el último comando de tu avance. Arréglalo porfas.