Петропавловский Андрей
Клеточная линия: Hsmm
Контроль: (HsmmControlStdAlnRep1.bam / wgEncodeBroadHistoneHsmmControlStdAlnRep1.bam)
| Гистоновая метка | Файл |
|---|---|
| H2az | H2az.bam |
| H3k27ac | H3k27ac.bam |
| H3k27me3 | H3k27me3.bam |
| H3K36me3 | H3k36me3.bam |
| H3K4me1 | H3k4me1.bam |
| H3K4me2 | H3k4me2.bam |
| H3K4me3 | H3k4me3.bam |
| H3K79me2 | H3k79me2.bam |
| Ctcf | Ctcf.bam |
| Ezh239875 | Ezh239875.bam |
Collab: тык
Во всем геноме наиболее встречаемым состоянием является 2е. Можем заметить, что с терминацией транскрипции в основном связано 3 состояние, а с началом 9е. Для cpg остравков наиболее частым состоянием является 9, также как и для экзонов.
Можно сделать вывод, что 9 тип - это промоторы
| # | название | описание |
|---|---|---|
| 1 | Repressed heterochromatin | Ассоциируется с Lamina |
| 2 | Repressed heterochromatin | Ассоциируется с % genome и Lamina |
| 3 | Exon | Активность в H3k36me3, совпадает с экзоном, геном и TES |
| 4 | Transcribed gene | Попадает на метки H3k79me2 и H3k36me3, совпадает с активным геном |
| 5 | Transcribed gene | Попадает на H3k79me2 |
| 6 | Weak enchancer | Ассоциируется с TES и попадает на попадает на H3k4me1 |
| 7 | Enchancer | Активен на H3k4me1, H3k4me2,H3k27ac, H2az |
| 8 | Weak Enchancer | Активен на H3k4me1, H3k4me2 и H2az |
| 9 | Promoter | Активен на метках, которые вроде связаны с промоторами |
| 10 | Transcriptional factor | Ассоциируется Ctcf и с Lamina |
React
Typescript
Django
Laravel
Facebook
Microsoft
Google
Alibaba
D3
Tencent